张教授的所有初中同学都不是博士；通过张教授而认识其哲学研究所同事的都是博士；

解析：“通过张教授而认识其哲学研究所同事的都是博士”换质换位之后为“非博士都不是通过张教授而认识其哲学研究所同事的”，也即“非博士通过张教授认识的人不是其哲学研究所同事”。由“张教授的所有初中同学都不是博士”得“张教授的一个初中同学不是博士”，又“张教授的一个初中同学通过张教授认识了王研究员”，因此，可以知道“王研究员不是张教授的哲学研究所同事”，即B选项。